三效蒸發器在進行操作的過程中主要是由相互串聯的三組蒸發器、鹽分離器、冷凝器以及輔助設備等組成三組蒸發器以串聯的形式運行，三效蒸發器在運行的過程中其整套蒸發系統主要是采用其連續進料連續出料的生產方式。

三效蒸發器在運行時首先進入一效強制循環結晶蒸發器，其設備在一定程度上會配有循環泵，在進行操作時會將其廢水打入蒸發換熱室內，在蒸發換熱室內，其外接的蒸汽液化就會產生汽化潛熱，這樣就可以在一定程度上對其廢水進行加熱。

三效蒸發器在一定程度上會由于其蒸發換熱室內的壓力較大，其廢水在蒸發換熱室中在高于其正常液體沸點壓力下加熱到過熱，其加熱后的液體會直接進入結晶蒸發室后，其廢水的壓力就會迅速下降導致部分廢水閃蒸，或迅速沸騰。廢水蒸發后的蒸氣進入二效強制循環蒸發器作為動力蒸氣對二效蒸發器進行加熱，未蒸發廢水和鹽分暫存在結晶蒸發室。